ACINETOBACTER CALCOACETICUS- ACINETOBACTER BAUMANNII COMPLEX(ABC) VE YENİ TÜRLERİ

Abstract

Acinetobacter cinsi’nin sınıandırılmasında 12 farklı genomik tür bulunduğu gösterilmiş, taksonomisinde son 30 yılda DNA-temelli metotların yaygın kullanımı sayesinde değişiklikler kaydedilmiştir. Bugün için Acinetobacter cinsi içerisinde 49 tür bulunmaktadır. A. calcoaceticus- A.baumannii complex içinde (ABC) klinik olarak önemli türler olan A. baumannii (genomik tür 2), Acinetobacter nosocomialis (genomik tür 13TU), Acinetobacter pittii (genomik tür 3) ve Acinetobacter calcoaceticus (genomik tür 1) türleri biyokimyasal olarak ayırd edilemezler. DNA-DNA hibridizasyon, rpoB gen sekans analizi ve multilocus sequence typing (MLST) ile A. calcoaceticus- A. baumannii complex’e son yıllarda iki yeni patojenik tür olan Acinetobacter seifertii ve Acinetobacter djikshoorniae eklenmiştir. Ayrıca non-A.baumannii türleri arasında plazmide lokalize blaNDM-1 geni taşıyan ve A. djikshoorniae’nın model suşu olan JVAP01T suşunun taslak genom dizilimi de yayınlanmıştır. Bugün için; Acinetobacter cinsinin tür düzeyinde ayrımı için; RNA polimeraz ?-subunit (rpoB) geni, DNA giraz B (gyrB) geni sekans analizi ve/veya multilocus sequence analysis (MLSA) altın standard moleküler metotlar olarak kabul edilmektedir. Diğer yöntemler; amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA), Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) , ve Matriks assisted lazer desorption ionization time of ight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)’dur. Acinetobacter türlerine karşı antimikrobiyal direnç gelişimini önlemek için izolatların tür düzeyinde güvenilir yöntemler kullanılarak tanımlanmaları, uygun antibiyotiklerin kullanılması ve kesintisiz enfeksiyon kontrol önlemlerinin uygulanması önemlidi